Sinds 2005 is Gertjan van der Linden in dienst bij de Nederlandse Basketball Bond en is op dit moment bondscoach van het Nederlandse vrouwen rolstoelbasketbalteam: de Orange Angels. Met hen traint hij op Papendal. Gertjan is van mening dat er een groot verschil bestaat tussen een bondscoach van een valide of mindervalide sporter. Vaak beginnen sporters pas na het revalidatieproces met rolstoelbasketbal. Hij coacht hen niet alleen bij de sport zelf, maar leert hen ook hoe er überhaupt met een rolstoel gesport kan worden. Het grote voordeel in deze tak van sport vindt Gertjan de grote wilskracht van Paralympische sporters. Gertjan was succesvol als speler (onder anderen Paralympisch goud), maar behaalde ook als coach zijn successen. Zo werd hij Europees kampioen in 2013 en 2017, behaalde brons op de Paralympics van 2012 en 2016 en sloot 2019 af als wereldkampioen met zijn vrouwenteam. Sinds dit jaar is er een gouden Paralympische medaille als coach toegevoegd aan zijn palmares: Tokyo werd winnend afgesloten.